РВШОМ открылась в 1994 году в Санкт-Петербурге при поддержке Академии медико-технических наук России и Виолы Фрайман, доктора остеопатии из США, которая со своими коллегами открыла остеопатию для врачей России.
Школа организовала остеопатическое обучение для врачей на академическом уровне, соединив высшее последипломное образование с фундаментальной наукой, благодаря сотрудничеству с 1995 года с НИИ эволюционной физиологии и биохимии им И.М. Сеченова РАН.
В настоящее время РВШОМ имеет большую научную базу, широко известную в остеопатическом международном сообществе.